提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
【网络中国节】舌尖上的腊八节:品尝第一缕年味******
今日腊八,岁末将至,年味渐浓。一碗腊八粥,承载着对于过年的期盼与喜悦。关于腊八节的美食,你了解多少?
(文图:赵筱尘 巫邓炎)
[责编:天天中]
阅读剩余全文()
推荐阅读
1分快3客户端下载如果隋文帝建一个群会聊什么
2024-03-04
1分快3代理何炅过生日与汪涵一同庆祝
2024-06-01
1分快3软件走深走实 行稳致远(钟声)
2024-04-10
1分快3注册纪连海带您见证中国酒文化的变迁史
2024-11-05
1分快3充值 沈梦辰穿上婚纱了!!关晓彤这次的红毯裙我无法吐槽
2024-11-05
1分快3手机版实拍:城管粗暴铲翻老太菜摊
2024-11-06
1分快3下载app企业出海赋能计划——《国际·跃》会员刊
2024-10-12
1分快3开奖结果训练赛内容被爆出,Viper怒喷宁王,网友:菜还不能说了?
2024-07-18
1分快3规则对赌的代价:冯小刚郑恺需补偿华谊兄弟近8800万
2024-03-12
1分快3漏洞敦促与华为共建5G,中国驻英大使在报纸上再发声
2024-10-29
1分快3邀请码对话同一地点3次救轻生者司机
2024-04-10
1分快3官方 百度回应李彦宏被指老赖事件:尊重法律,但...
2024-09-03
1分快3平台超期待 杨紫琼加盟《阿凡达》续集
2024-01-29
1分快3登录西藏日喀则 领略高原深处的春耕美景
2024-10-14
1分快3app超甜校园剧同款元气妆
2024-04-20
1分快3登录美影院推出59小时"复联套餐"
2024-02-21
1分快3注册网警方介入海南涉假HPV疫苗案,即将公诉
2024-06-19
1分快3下载刚买一年价格掉一半!新能源车,为啥转手就尴尬
2024-06-15
1分快3计划群日本住宅空置率创新高!有城市两成房屋没人住
2024-04-07
1分快3攻略周冬雨宋茜的初夏最爱 清爽衬衫裙迎五一小长假
2024-08-27
1分快3网址 西甲-西班牙人前瞻:武磊盼延续进球势头 定欧战命运
2024-03-26
1分快3开户2年冲到纳斯达克,瑞幸“拼”过拼多多?
2024-07-04
1分快3客户端给孩子做饭难?“常回家做饭”快成奢侈品
2024-05-03
1分快3交流群商务部:今年上半年公布新的外资准入负面清单
2024-02-07
加载更多 1分快3地图